徐泽凌- 群体微生物研究中心/植物保护学院

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徐泽凌更新日期: 2024年4月15日

徐泽凌，男，汉族，1992年8月生，浙江金华市人，群众，博士研究生学历，哲学博士，副研究员，硕导。

个人简介

长期从事分子微生物学与生物化学研究，研究方向包括（1）细菌致病性与耐药性机理研究，（2）细菌金属离子稳态调控机制研究，（3）微生物CRISPR-Cas基因编辑等。已发表论文30余篇，其中以第一作者或通讯作者在Cell Reports、PLoS Pathogens、Nucleic Acids Research、Microbiome、Environmental Microbiology、Applied and Environmental Microbiology、Journal of Biological Chemistry等国际期刊上发表论文10余篇。担任Frontiers in Microbiology、Journal of Visualized Experiments 等SCI学术期刊客座编辑，以及Nature Communications、Frontiers in Microbiology、Microbiology Spectrum、BMC Genomics、Scientific Reports、STAR Protocols等国际期刊的审稿人。

工作经历

2021.2-至今：，副研究员
2019.2-2021.1：香港大学，博士后

教育经历

2014.9-2019.1：香港大学，分子微生物学和生物化学专业，博士
2010.9-2014.6：浙江大学，应用生物科学专业，学士

社会、学会及学术兼职

《Frontiers in Microbiology》《Journal of Visualized Experiments》客座编辑；《Frontiers in Genome Editing》评审编辑；《学报》首届青年编委

研究领域

以动植物病原微生物为研究对象，主要开展以下方向研究：
[1] 细菌致病性与耐药性机理研究
[2] 细菌金属离子稳态调控机制研究
[3] 微生物CRISPR-Cas基因编辑

科研项目

[1] 国家自然科学基金面上项目, 铜绿假单胞菌CDA群体感应系统调控T3SS基因表达的分子机制研究, 2024.01 - 2027.12, 主持
[2] 国家自然科学基金青年科学基金项目, 锌胁迫抑制铜绿假单胞菌群体感应系统的作用机制研究, 2022.01 - 2024.12, 主持
[3] 广东省自然科学基金面上项目, 锌离子调控铜绿假单胞菌左氧氟沙星耐药性的分子机制研究, 2023.01 - 2025.12, 主持
[4] 广东省自然科学基金面上项目, 铜绿假单胞菌中双组分系统FleS/FleR对III型分泌系统的调控机制研究, 2022.01 - 2024.12, 主持
[5] 广州市基础与应用基础研究项目, 铜绿假单胞菌中双组分系统FleS/FleR调控生物膜形成的分子机理研究, 2022.04 - 2024.03, 主持
[6] 国家重点研发计划, 华南地区重要粮油作物根际微生物组动态与作物病害发生及关键微生物挖掘, 2022.12 - 2026-11, 参与
[7] 新农村发展研究院农村科技特派员服务团队项目, 2021.07 - 2023.07, 参与
[8] 温氏食品集团股份有限公司, 养殖废水通过藻类转化成畜禽饲用产品的关键技术研究与示范, 2023.03 - 2025.12, 参与
[9] Health and Medicine Research Fund (香港医疗卫生研究基金HMRF), Establishing a Pseudomonas aeruginosa-Caenorhabditis elegans embryogenesis model for assessment of the P. aeruginosa virulence and identification of novel virulence factors, 2020.07 - 2023.06, 参与

发表论文

[1] Huang J, Xu Z, Zhou T, Zhang L*, Xu Z*. Suppression of Pseudomonas aeruginosa type III secretion system by a novel calcium-responsive signaling pathway. iScience, 2024.
[2] Li T#, Cao H#, Duan C, Chen S, Xu Z*. Activation of CzcS/CzcR during zinc excess regulates copper tolerance and pyochelin biosynthesis of Pseudomonas aeruginosa. Applied and Environmental Microbiology, 2024; 90(3): e02327-2.
[3] Chen S#, Cao H#, Xu Z, Huang J, Liu Z, Li T, Duan C, Wu W, Wen Y, Zhang L, Xu Z*. A type I-F CRISPRi system unveils the novel role of CzcR in modulating multidrug resistance of Pseudomonas aeruginosa. Microbiology Spectrum 2023; 11: e01123-23.
[4] Xu Z, Park TJ and Cao H*. Advances in mining and expressing microbial biosynthetic gene clusters. Critical Reviews in Microbiology, 2023; 49(1): 18-37.
[5] Lin Q, Huang J, Liu Z, Chen Q, Wang X, Yu G, Cheng P, Zhang L*, Xu Z*. tRNA modification enzyme MiaB connects environmental cues to activation of Pseudomonas aeruginosa type III secretion system. PLoS Pathogens, 2022; 18(12): e1011027.
[6] Liu Z#, Xu Z#, Chen S, Huang J, Li T, Duan C, Zhang L*, Xu Z*. CzcR Is Essential for Swimming Motility in Pseudomonas aeruginosa during Zinc Stress. Microbiology Spectrum, 2022;10(6):e0284622.
[7] Lin S#, Chen S#, Li L*, Cao H, Li T, Hu M, Liao L, Zhang L, Xu Z*. Genome characterization of a uropathogenic Pseudomonas aeruginosa isolate PA_HN002 with cyclic di-GMP-dependent hyper-biofilm production. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2022;12: 956445.
[8] Zhou T, Huang J, Liu Z, Lin Q, Xu Z* and Zhang L*. The two-component system FleS/FleR represses H1-T6SS via c-di-GMP signaling in Pseudomonas aeruginosa. Applied and Environmental Microbiology, 2022;88: e01655-21.
[9] Duan C, Cao H, Zhang L* and Xu Z*. Harnessing the CRISPR-Cas systems to combat antimicrobial resistance. Frontiers in Microbiology, 2021;12: 716064.
[10] Zhou T, Huang J, Liu Z, Xu Z* and Zhang L*. Molecular Mechanisms Underlying the Regulation of Biofilm Formation and Swimming Motility by FleS/FleR in Pseudomonas aeruginosa. Frontiers in Microbiology, 2021;12: 707711.
[11] Xu Z, Li Y, Cao H, Si M, Zhang G, Woo P, Yan A*. A transferrable and integrative type I-F Cascade for heterologous genome editing and transcription modulation. Nucleic Acids Research, 2021;49: e94.
[12] Li Y#, Xu Z#, Han W#, Cao H#, Umarov R, Yan A, Fan M, Chen H, Duarte C, Li L, Ho P, Gao X*. HMD-ARG: Hierarchical Multi-task Deep learning for Annotating Antibiotic Resistance Genes, Microbiome, 2021;9: 40.
[13] Xu Z, Li Y, Li M, Xiang H, Yan A*. Harnessing the type I CRISPR-Cas systems for genome editing in prokaryotes, Environmental Microbiology, 2021;23:542-558.
[14] Xu Z*, Li Y, Yan A*. Repurposing the native type I-F CRISPR-Cas system in P. aeruginosa for genome editing, STAR Protocols, 2020;1: 100039.
[15] Xu Z#, Li M#, Li Y, Cao H, Miao L, Xu Z, Higuchi Y, Yamasaki S, Nishino K, Woo P, Xiang H*, Yan A*. Native CRISPR-Cas-mediated genome editing enables dissecting and sensitizing clinical multidrug-resistant P. aeruginosa, Cell Reports, 2019;29: 1707–1717.
[16] Xu Z, Wang P, Wang H, Yu ZH, Au-Yeung HY, Hirayama T, Sun H, Yan A*. Zinc excess increases cellular demand for iron and decreases tolerance to copper in Escherichia coli, Journal of Biological Chemistry, 2019;294: 16978–16991.
[17] Xu Z, Yan A*. Multidrug efflux systems in microaerobic and anaerobic bacteria, Antibiotics 2015; 4, 379-396.

科研创新

[1] Yan A, Xu Z. A transferable type I-F CRISPR-Cas system for genome editing in P. aeruginosa, PCT/CN2021/128715
[2] 徐泽凌，陈淑珍，刘志晴，徐梓锐，张炼辉。一种基因表达调控系统及其应用，专利号：ZL202210069861.X，申请号：202210069861.X
[3] 徐泽凌，陈淑珍，刘志晴，张炼辉。一种用于基因编辑的组合物及其应用，申请号：202310078804.2

指导学生

博士研究生（二导）：刘志晴、王新博、黄嘉惠、顾惟涵
硕士研究生：陈淑珍（2021）、李婷（2021）、徐梓锐（2021）、吴炜妍（2022）、温咏琪（2022）、陈明（2022）、王静宜（2023）、莫知凤（2023）

陈淑珍， 2021-2022学年“范怀忠奖学金”，一等奖学金；
陈淑珍等， 2022年“丁颖杯”发明创意大赛，植物保护学院一等奖，校级三等奖；
林思颖，2022年“丁颖杯”暨“挑战杯”广东课外学术科技竞赛校内选拔赛，校级二等奖；
林思颖等，2023年广东省科技创新战略专项资金“攀登计划”，一般项目，1.5万元；
张耀等，2023年大学生创新创业训练计划，国家级立项。