研究领域：

以植物病原微生物为主要研究对象，开展以下方向研究：

1. 微生物基因组学；

2. 病原微生物致病分子机理和调控机制；

3. 生物信息学（比较基因组学和高通量测序数据分析等方向）。

学习经历：

2001–2005   上海交通大学   学士

2006–2011   美国宾夕法尼亚州立大学   博士

工作经历：

2011-2016  美国范德堡大学   博士后

2016-         首聘教授

社会兼职：

担任SCI学术期刊《Frontiers in Ecology and Evolution》副主编、《Frontiers in Microbiology》客座副主编、《Frontiers in Genetics》评审编辑。

荣誉或奖励

广东省“珠江人才计划”青年拔尖人才（2018）

代表性论文：

1.Zhou J#, Hu M#, Hu A#, Li C, Ren X, Tao M, Xue Y, Chen S, Tang C, Xu Y, Zhang L, Zhou X*. Isolation and genome analysis of Pectobacterium colocasium sp. nov. and P. aroidearum, two new pathogens of taro. Frontiers in Plant Science. 2022 Mar 28. doi: 10.3389/fpls.2022.852750. Epub 2022 Mar 28.

2.Liu Y#, Ahator SD#, Wang H, Feng Q, Xu Y, Li C, Zhou X*, Zhang L*. Genome diversity and quorum sensing variations in laboratory strains of Pseudomonas aeruginosa PAO1. Frontiers in Microbiology. 2022 Feb 16. doi: 10.3389/fmicb.2022.821895. Epub 2022 Feb 16.

3.Lv M#, Chen Y#, Hu M, Yu Q, Duan C, Ye S, Ling J, Zhou J, Zhou X*, Zhang L*, OhrR is a central transcriptional regulator of virulence in Dickeya zeae. Molecular Plant Pathology. 2022 Jan; 23(1):45-59. doi: 10.1111/mpp.13141. Epub 2021 Oct 24.

4.Hu M, Xue Y, Li C, Lv M, Zhang L, Parsek MR, Lu G, Zhou X*, Zhou J*. Genomic and Functional Dissections of Dickeya zeae Shed Light on the Role of Type III Secretion System and Cell Wall-Degrading Enzymes to Host Range and Virulence. Microbiology Spectrum. 2022 Feb 23; 10(1):e0159021. doi: 10.1128/spectrum.01590-21. Epub 2022 Feb 2.

5.Hu M, Li C, Xue Y, Hu A, Chen S, Chen Y, Lu G, Zhou X*, Zhou J*. Isolation, Characterization, and Genomic Investigation of a Phytopathogenic Strain of Stenotrophomonas maltophilia Phytopathology. 2021 Nov; 111(11):2088-2099. doi: 10.1094/PHYTO-11-20-0501-R. Epub 2021 Nov 11.

6.Zhou X, Lutteropp S, Czech L, Stamatakis A, Looz MV, Rokas A*. Quartet-based computations of internode certainty provide robust measures of phylogenetic incongruence. Systematic Biology. 2020 Mar 1; 69(2):308-324. doi: 10.1093/sysbio/syz058. 

7.Zheng L, Situ J, Zhu Q, Xi P, Zheng Y, Liu H, Zhou X*, Jiang Z*. Identification of volatile organic compounds for the biocontrol of postharvest litchi fruit pathogen Peronophythora litchi. Postharvest Biology and Technology. 2019 Sep; 155:37-46. doi: 10.1016/j.postharvbio.2019.05.009.

8.Zhong Y#, Yan M#, Jiang J#, Zhang Z, Huang J, Zhang L, Deng Y*, Zhou X*, He F*. Mycophenolic acid as a promising fungal dimorphism inhibitor to control sugar cane disease caused by Sporisorium scitamineum. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2019 Jan 9; 67(1):112-119. doi: 10.1021/acs.jafc.8b04893. Epub 2018 Dec 28.

9.Shen X#, Opulente DA#, Kominek J#, Zhou X#, Steenwyk JL, Buh KV, Haase MAB, Wisecaver JH, Wang M, Doering DT, Boudouris JT, Schneider RM, Langdon QK, Ohkuma M, Endoh R, Takashima M, Manabe R, Cadez N, Libkind D, Rosa CA, DeVirgilio J, Hulfachor AB, Groenewald M, Kurtzman CP, Hittinger CT*, Rokas A*. Tempo and mode of genome evolution in the budding yeast subphylum. Cell. 2018 Nov 29; 175(6):1533-1545.e20. doi: 10.1016/j.cell.2018.10.023. Epub 2018 Nov 8.

10.Zhou X, Shen X, Hittinger CT, Rokas A*, Evaluating fast maximum likelihood-based phylogenetic programs using empirical phylogenomic data sets. Molecular Biology and Evolution. 2018 Feb 1;35(2):486-503. doi: 10.1093/molbev/msx302.

科研项目：

1.广东省自然科学基金面上项目，转录调控因子PhcX对茄青枯劳尔氏菌的致病性调控研究，2022.01-2024.12, 10万元，在研，主持；

2.广东省普通高校重点领域研究项目（特色创新项目），木麻黄青枯病菌关键致病基因鉴定和功能研究，2021.9-2023.8，10万元，在研，主持；

3.广东省科技创新战略专项资金（重点领域研发计划），基于代谢组学的水稻病虫抗性与产量平衡机制研究，2020.9-2023.8，1000万元，在研，主持子课题（经费200万元）；

4.国家重点基础研究计划（973 计划），微生物群体感应通讯系统与病害防控基础研究，2015.01-2019.08，3500万元，已结题，主持子课题（经费55.2万元）；

教学活动：

主讲《生物信息学》（全英）、《生物信息学实验》等本科生课程；参讲《植物保护研究进展》、《植物病理学》等研究生课程。